Всё для поиска возбудителя инфекции
Обзор современных методов этиологической диагностики: масс-спектрометрия
Сегодня поговорим об открытии масс-спектрометрии и её применении для идентификации микроорганизмов.
Матричная лазерная десорбционная ионизация в сочетании с времяпролетной (MALDI-TOF) масс-спектрометрией (МS) стала важным диагностическим инструментом в ветеринарии. В последнее десятилетие произошел прорыв использования MALDI-TOF MS для идентификации микроорганизмов на основе измерения уникальных белков, специфичных для определенных микроорганизмов. Благодаря созданию библиотек масс-спектров с возможностью поиска идентификация микроорганизмов может происходить с высокой достоверностью в течение нескольких минут после завершения этапа культивирования клеток.
О времяпролетной ионизации и лазерной десорбции с использованием матрицы впервые сообщила исследовательская группа Франца Хилленкампа в 1987 г., а последующая работа К. Танака из Шимадзу была опубликована в 1988 г. В этих ранних работах было установлено, что при добавлении к образцу светопоглощающего компонента, называемого «матрицей», свет от мощного ультрафиолетового (УФ) лазера можно использовать для десорбции и ионизации различных высокомолекулярных соединений. Матрица, смешанная с образцом, существенно способствует процессу десорбции/ионизации за счет физических механизмов, которые до сих пор полностью не изучены. Эти открытия были революционными для того времени, потому что биомолекулы с молекулярной массой до 67 кДа могли десорбироваться в газовую фазу и ионизироваться как целые молекулы! До этой работы улетучивание таких больших нелетучих молекул было неслыханным и считалось невозможным.
Использование MALDI-TOF для быстрого выявления инфекционных вспышек на фермах является актуальным применением этого метода. Другой важной областью ветеринарии, в которой используются измерения MALDI-TOF, является диагностика мастита у молочных животных. Это очень важно, ведь ошибочный диагноз может привести к выбору неправильной схемы лечения и препятствовать разумному использованию антибиотиков.
В то время как идентификация бактериальных микроорганизмов остается самой большой областью применения этого метода, разрабатываются новые захватывающие направления исследований для энтомологии/паразитологии/грибковых инфекций, для молекулярного и белкового профилирования, химической визуализации тканей и др.
По материалам статьи
Thompson JE. Matrix-assisted laser desorption ionization-time-of-flight mass spectrometry in veterinary medicine: Recent advances (2019-present). Vet World. 2022;15(11):2623-2657. doi:10.14202/vetworld.2022.2623-2657
Исследование для выявления ДНК Salmonella spp. методом амплификации ДНК с флуоресцентной детекцией в режиме «реального времени».
Вид материала КРС: цельная кровь, секрет молочной железы, биоптаты и аутоптаты (ткани паренхиматозных органов, ткани абортированных плодов) ректальные соскобы, фекалии
Вид материала Птицы: помет, биоптаты и аутоптаты (ткани паренхиматозных органов)
Код услуги: П8.18
Срок выполнения: 2 суток
Исследование для выявления ДНК Aspergillus terreus, ДНК Aspergillus niger методом амплификации ДНК с флуоресцентной детекцией в режиме «реального времени».
Вид материала: соскоб с пораженного участка кожи или слизистой, раневое отделяемое, аутоптат/бипотат
Код услуги: П8.67
Срок выполнения: 2 суток
Исследование для выявления ДНК Aspergillus fumigatus, ДНК Aspergillus flavus методом амплификации ДНК с флуоресцентной детекцией в режиме «реального времени».
Вид материала: соскоб с пораженного участка кожи или слизистой, раневое отделяемое, аутоптат/бипотат
Код услуги: П8.66
Срок выполнения: 2 суток
Исследование для выявления ДНК Chlamydia spp. методом амплификации ДНК с флуоресцентной детекцией в режиме «реального времени».
Вид материала: смывы и cоскобы слизистых со слизистых оболочек верхних дыхательных путей, конъюнктивы, урогенитального тракта; фрагменты тканей и органов; эякулят
Код услуги: П8.4
Срок выполнения: 2 суток
Тест-система чувствительна к С.psittaci, С.pecorum, С. pneumoniae, С. abortus, С. felis, С. caviae, C. trachomatis, C. suis, C.avium, C. gallinacea.
Результат исследования выдается не дифференцировано.
Исследование для выявления ДНК бактерий рода Mycoplasma методом амплификации ДНК с флуоресцентной детекцией в режиме «реального времени».
Вид материала: смывы и cоскобы слизистых со слизистых оболочек верхних дыхательных путей, конъюнктивы, урогенитального тракта; фрагменты тканей и органов; эякулят; фекалии/помет
Код услуги: П8.3
Срок выполнения: 2 суток
Исследование для выявления ДНК Listeria monocytogenes методом амплификации ДНК с флуоресцентной детекцией в режиме «реального времени.
Вид материала КРС: смывы и соскобы со слизистых оболочек верхних дыхательных путей, урогенитального тракта; цельная кровь, секрет молочной железы, фекалии, ткани внутренних органов, абортированных плодов, плодные оболочки, плацента
Вид материала Птицы: мывы и соскобы со слизистых оболочек верхних дыхательных путей; ткани внутренних органов, помет
Код услуги: П8.17
Срок выполнения: 2 суток
Исследование для выявления РНК aMPV-A,B (метапневмовируса птиц типов А и В) методом обратной транскрипции РНК с последующей амплификацией кДНК с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени.
Вид материала: соскобы, фрагменты пораженных органов и тканей (трахея, легкие, желудок, яйцевод)
Код услуги: П8.27
Срок выполнения: 2 суток
Исследование для выявления РНК вируса гриппа А (с идентификацией субтипов H5, H7, H9) методом обратной транскрипции РНК с последующей амплификацией кДНК с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени.
Вид материала: соскобы верхних и нижних дыхательных путей, клоакальные смывы, помет, фрагменты органов (трахея, легкие, селезенка, воздухоносные мешки, кишечник), фрагменты мышечной ткани, яйца, аллантоисная жидкость эмбрионов кур
Код услуги: П8.2
Срок выполнения: 2 суток
Исследование для дифференциального выявления РНК вируса гриппа А и РНК вируса гриппа А (субтип H5) методом обратной транскрипции РНК с последующей амплификацией кДНК с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени.
Вид материала: Соскобы верхних и нижних дыхательных путей, клоакальные смывы, помет, фрагменты органов (трахея, легкие, селезенка, воздухоносные мешки, кишечник), фрагменты мышечной ткани, яйца, аллантоисная жидкость эмбрионов кур
Код услуги: П8.90
Срок выполнения: 2 суток
Исследование для выявления РНК вируса инфекционной бурсальной болезни (возбудителя болезни Гамборо) методом обратной транскрипции РНК с последующей амплификацией кДНК с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени.
Вид материала: Фрагменты фабрициевой сумки и мышечной ткани, селезенки, лимфатической ткани, сыворотка крови, помет, куриные эмбрионы, яйца
Код услуги: П8.16
Срок выполнения: 2 суток
Отвечает микробиолог
Обзор современных методов этиологической диагностики: масс-спектрометрия
В помощь ветеринарному врачу новая панель для ПЦР-диагностики
Вебинар "Инфекционная безопасность пищи"
Взаимосвязь, которую нужно контролировать
Роль самца в инфекционном бесплодии крупного рогатого скота
Участие в Евразийском ресторанном форуме
