Всё для поиска возбудителя инфекции
Обзор современных методов этиологической диагностики: масс-спектрометрия
Сегодня поговорим об открытии масс-спектрометрии и её применении для идентификации микроорганизмов.
Матричная лазерная десорбционная ионизация в сочетании с времяпролетной (MALDI-TOF) масс-спектрометрией (МS) стала важным диагностическим инструментом в ветеринарии. В последнее десятилетие произошел прорыв использования MALDI-TOF MS для идентификации микроорганизмов на основе измерения уникальных белков, специфичных для определенных микроорганизмов. Благодаря созданию библиотек масс-спектров с возможностью поиска идентификация микроорганизмов может происходить с высокой достоверностью в течение нескольких минут после завершения этапа культивирования клеток.
О времяпролетной ионизации и лазерной десорбции с использованием матрицы впервые сообщила исследовательская группа Франца Хилленкампа в 1987 г., а последующая работа К. Танака из Шимадзу была опубликована в 1988 г. В этих ранних работах было установлено, что при добавлении к образцу светопоглощающего компонента, называемого «матрицей», свет от мощного ультрафиолетового (УФ) лазера можно использовать для десорбции и ионизации различных высокомолекулярных соединений. Матрица, смешанная с образцом, существенно способствует процессу десорбции/ионизации за счет физических механизмов, которые до сих пор полностью не изучены. Эти открытия были революционными для того времени, потому что биомолекулы с молекулярной массой до 67 кДа могли десорбироваться в газовую фазу и ионизироваться как целые молекулы! До этой работы улетучивание таких больших нелетучих молекул было неслыханным и считалось невозможным.
Использование MALDI-TOF для быстрого выявления инфекционных вспышек на фермах является актуальным применением этого метода. Другой важной областью ветеринарии, в которой используются измерения MALDI-TOF, является диагностика мастита у молочных животных. Это очень важно, ведь ошибочный диагноз может привести к выбору неправильной схемы лечения и препятствовать разумному использованию антибиотиков.
В то время как идентификация бактериальных микроорганизмов остается самой большой областью применения этого метода, разрабатываются новые захватывающие направления исследований для энтомологии/паразитологии/грибковых инфекций, для молекулярного и белкового профилирования, химической визуализации тканей и др.
По материалам статьи
Thompson JE. Matrix-assisted laser desorption ionization-time-of-flight mass spectrometry in veterinary medicine: Recent advances (2019-present). Vet World. 2022;15(11):2623-2657. doi:10.14202/vetworld.2022.2623-2657
Исследование для выявления РНК инфекционного бронхита кур методом обратной транскрипции РНК с последующей амплификацией кДНК с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени.
Вид материала: Смывы с конъюнктивы глаз, ротоглотки, трахеи, клоаки; фрагменты паренхиматозных органов, яйцеводов, кишечника, верхних дыхательных путей, эмбрионов и яиц
Код услуги: П8.14
Срок выполнения: 2 суток
Исследование для выявления ДНК вируса инфекционного ларинготрахеита кур (GaHV-1) методом амплификации ДНК с флуоресцентной детекцией в режиме «реального времени».
Вид материала: Соскобы и смывы верхних и нижних дыхательных путей, конъюнктивы, фрагменты органов (трахея, бронхи, конъюнктива)
Код услуги: П8.1
Срок выполнения: 2 суток
Исследование для дифференциального выявления ДНК Mycoplasma synoviae и Mycoplasma gallisepticum методом амплификации ДНК с флуоресцентной детекцией в режиме «реального времени».
Вид материала: Цельная кровь, смывы с конъюнктивы глаз, ротоглотки, трахеи, фрагменты паренхиматозных органов, верхних дыхательных путей, эмбрионов и яиц
Код услуги: П8.13
Срок выполнения: 2 суток
Исследование для выявления РНК реовирусной инфекции птиц методом обратной транскрипции РНК с последующей амплификацией кДНК с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени.
Вид материала: Соскобы верхних и нижних дыхательных путей, клоакальные смывы, помет, фрагменты органов (трахея, желудок, легкие, селезенка, воздухоносные мешки, кишечник).
Код услуги: П8.91
Срок выполнения: 2 суток
Исследование для выявления РНК вируса болезни Ньюкасла (Newcastle disease virus) методом обратной транскрипции РНК с последующей амплификацией кДНК с флуоресцентной детекцией в режиме реального времени.
Вид материала:
смывы с конъюнктивы глаз, ротоглотки, трахеи, клоаки;
фрагменты паренхиматозных органов, верхних дыхательных путей, эмбрионов и яиц;
помет
Код услуги: П8.15
Срок выполнения: 2 суток
Исследование для выявления ДНК Chlamydophila psittaci методом амплификации ДНК с флуоресцентной детекцией в режиме «реального времени.
Вид материала: смывы или соскобы слизистых оболочек, биоптаты и аутоптаты органов и тканей (трахеи, легкие, кишечник)
Код услуги: П8.64
Срок выполнения: 2 суток
Исследование для выявления ДНК Mycobacterium avium complex, M. Avium методом амплификации ДНК с флуоресцентной детекцией в режиме «реального времени».
Вид материала: смывы и соскобы со слизистых оболочек верхних дыхательных путей, смывы из нижних дыхательных путей, биоптаты и аутоптаты органов и тканей
Код услуги: П8.83
Срок выполнения: 2 суток
Антитела: Обнаружение антител к реовирусу птиц (бройлеры, племенная птица, куры-несушки)
Вид материала: Сыворотка крови кур и индеек
Код услуги: И4.8
Срок выполнения: 2 суток
Антитела: Определение количественного уровня антител к вирусу ИББ до и после вакцинации.
Вид материала: Сыворотка крови кур
Код услуги: И4.6
Срок выполнения: 2 суток
Антитела: Обнаружение всех вариантов вируса инфекционного бронхита (IBV), включая штаммы QX и 793B. Для диагностики болезни или для определения количественного уровня антител к вирусу инфекционного бронхита у вакцинированных птиц.
Вид материала: Сыворотка крови, яичный желток кур (бройлеры, племенная птица, куры-несушки)
Код услуги: И4.3
Срок выполнения: 2 суток